Select a Metric:   Select a Category:

days_since_epochSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
1417310.0 0.569 0.031 2.900 0.300 2.400 0.200
1417311.0 0.530 0.029 3.200 nan 2.500 0.100
1417312.0 0.604 0.008 3.650 0.250 2.850 0.150
1417313.0 0.623 0.018 3.800 0.400 2.850 0.150
1417314.0 0.585 0.019 3.625 0.575 2.850 0.150
1417315.0 0.627 0.016 3.725 0.025 2.950 0.150
1417316.0 0.636 0.006 3.825 0.275 3.000 nan
1417317.0 0.658 0.007 4.950 0.250 3.400 nan
1417318.0 0.629 0.018 4.450 0.550 3.400 0.100
1417319.0 0.642 0.010 5.275 0.325 3.650 0.150
1417320.0 0.659 0.007 4.925 0.375 3.600 0.200
1417410.0 0.556 0.395 4.421 3.818 3.000 1.495
1417411.0 0.582 0.426 4.487 3.920 3.150 1.626
1417412.0 0.584 0.429 3.958 2.904 3.225 1.659
1417413.0 0.602 0.455 4.308 3.445 3.400 1.892
1417414.0 0.599 0.451 4.875 4.541 3.300 1.847
1417415.0 0.596 0.447 5.300 5.155 3.525 2.104
1417416.0 0.612 0.470 4.658 4.161 3.525 2.214
1417417.0 0.597 0.448 5.125 4.912 3.450 2.038
1417418.0 0.610 0.467 5.100 4.809 3.650 2.317
1417419.0 0.632 0.501 6.675 7.531 3.875 2.701
1417420.0 0.630 0.498 6.412 7.077 3.850 2.658
1417510.0 0.458 0.058 1.733 0.544 1.667 0.478
1417511.0 0.448 0.051 1.700 0.535 1.567 0.403
1417512.0 0.461 0.059 1.833 0.624 1.700 0.497
1417513.0 0.458 0.058 1.733 0.544 1.667 0.478
1417514.0 0.464 0.062 1.867 0.660 1.733 0.525
1417515.0 0.472 0.072 1.867 0.660 1.767 0.556
1417516.0 0.487 0.089 2.067 0.899 1.867 0.660
1417517.0 0.468 0.066 1.867 0.660 1.767 0.556
1417518.0 0.493 0.098 2.200 1.071 1.933 0.736
1417519.0 0.493 0.098 2.200 1.071 1.933 0.736
1417520.0 0.488 0.090 2.133 0.984 1.900 0.698
DescriptionSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
all sequences identical, map to GG 295053 at 97 percent id10.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
all sequences identical, map to GG 295053 at 97 percent id11.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
all sequences identical, map to GG 295053 at 97 percent id12.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
all sequences identical, map to GG 295053 at 97 percent id13.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
all sequences identical, map to GG 295053 at 97 percent id14.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
all sequences identical, map to GG 295053 at 97 percent id15.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
all sequences identical, map to GG 295053 at 97 percent id16.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
all sequences identical, map to GG 295053 at 97 percent id17.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
all sequences identical, map to GG 295053 at 97 percent id18.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
all sequences identical, map to GG 295053 at 97 percent id19.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
all sequences identical, map to GG 295053 at 97 percent id20.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
fecal110.0 0.468 nan 1.900 nan 1.900 nan
fecal111.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
fecal112.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
fecal113.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
fecal114.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
fecal115.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
fecal116.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
fecal117.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
fecal118.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
fecal119.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
fecal120.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
fecal210.0 0.524 nan 2.300 nan 2.100 nan
fecal211.0 0.504 nan 2.300 nan 1.900 nan
fecal212.0 0.524 nan 2.500 nan 2.100 nan
fecal213.0 0.524 nan 2.300 nan 2.100 nan
fecal214.0 0.533 nan 2.600 nan 2.200 nan
fecal215.0 0.557 nan 2.600 nan 2.300 nan
fecal216.0 0.600 nan 3.200 nan 2.600 nan
fecal217.0 0.543 nan 2.600 nan 2.300 nan
fecal218.0 0.620 nan 3.600 nan 2.800 nan
fecal219.0 0.620 nan 3.600 nan 2.800 nan
fecal220.0 0.603 nan 3.400 nan 2.700 nan
identical sequences to fecal210.0 0.468 nan 1.900 nan 1.900 nan
identical sequences to fecal211.0 0.459 nan 1.800 nan 1.800 nan
identical sequences to fecal212.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
identical sequences to fecal213.0 0.468 nan 1.900 nan 1.900 nan
identical sequences to fecal214.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
identical sequences to fecal215.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
identical sequences to fecal216.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
identical sequences to fecal217.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
identical sequences to fecal218.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
identical sequences to fecal219.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
identical sequences to fecal220.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
palm1, contains one randomly generated sequence10.0 0.538 nan 2.600 nan 2.200 nan
palm1, contains one randomly generated sequence11.0 0.501 nan 3.200 nan 2.400 nan
palm1, contains one randomly generated sequence12.0 0.611 nan 3.400 nan 2.700 nan
palm1, contains one randomly generated sequence13.0 0.604 nan 4.200 nan 3.000 nan
palm1, contains one randomly generated sequence14.0 0.604 nan 4.200 nan 3.000 nan
palm1, contains one randomly generated sequence15.0 0.611 nan 3.700 nan 2.800 nan
palm1, contains one randomly generated sequence16.0 0.630 nan 4.100 nan 3.000 nan
palm1, contains one randomly generated sequence17.0 0.665 nan 5.200 nan 3.400 nan
palm1, contains one randomly generated sequence18.0 0.612 nan 5.000 nan 3.300 nan
palm1, contains one randomly generated sequence19.0 0.632 nan 5.600 nan 3.500 nan
palm1, contains one randomly generated sequence20.0 0.666 nan 5.300 nan 3.400 nan
palm210.0 1.102 nan 10.983 nan 5.500 nan
palm211.0 1.192 nan 11.250 nan 5.900 nan
palm212.0 1.199 nan 8.933 nan 6.000 nan
palm213.0 1.272 nan 10.233 nan 6.600 nan
palm214.0 1.260 nan 12.700 nan 6.400 nan
palm215.0 1.248 nan 14.200 nan 7.100 nan
palm216.0 1.313 nan 11.833 nan 7.300 nan
palm217.0 1.252 nan 13.600 nan 6.900 nan
palm218.0 1.304 nan 13.400 nan 7.600 nan
palm219.0 1.392 nan 19.700 nan 8.500 nan
palm220.0 1.385 nan 18.650 nan 8.400 nan
randomly generated sequence plus some variants, these should not map to 16S10.0 0.000 nan 1.800 nan 1.800 nan
randomly generated sequence plus some variants, these should not map to 16S11.0 0.000 nan 1.900 nan 1.900 nan
randomly generated sequence plus some variants, these should not map to 16S12.0 0.000 nan 1.900 nan 1.900 nan
randomly generated sequence plus some variants, these should not map to 16S13.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
randomly generated sequence plus some variants, these should not map to 16S14.0 0.000 nan 1.800 nan 1.800 nan
randomly generated sequence plus some variants, these should not map to 16S15.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
randomly generated sequence plus some variants, these should not map to 16S16.0 0.000 nan 1.900 nan 1.900 nan
randomly generated sequence plus some variants, these should not map to 16S17.0 0.000 nan 1.900 nan 1.900 nan
randomly generated sequence plus some variants, these should not map to 16S18.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
randomly generated sequence plus some variants, these should not map to 16S19.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
randomly generated sequence plus some variants, these should not map to 16S20.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
tongue1, contains one randomly generated sequence10.0 0.600 nan 3.200 nan 2.600 nan
tongue1, contains one randomly generated sequence11.0 0.559 nan 3.200 nan 2.600 nan
tongue1, contains one randomly generated sequence12.0 0.596 nan 3.900 nan 3.000 nan
tongue1, contains one randomly generated sequence13.0 0.641 nan 3.400 nan 2.700 nan
tongue1, contains one randomly generated sequence14.0 0.566 nan 3.050 nan 2.700 nan
tongue1, contains one randomly generated sequence15.0 0.642 nan 3.750 nan 3.100 nan
tongue1, contains one randomly generated sequence16.0 0.642 nan 3.550 nan 3.000 nan
tongue1, contains one randomly generated sequence17.0 0.651 nan 4.700 nan 3.400 nan
tongue1, contains one randomly generated sequence18.0 0.647 nan 3.900 nan 3.500 nan
tongue1, contains one randomly generated sequence19.0 0.652 nan 4.950 nan 3.800 nan
tongue1, contains one randomly generated sequence20.0 0.652 nan 4.550 nan 3.800 nan
tongue210.0 0.652 nan 3.000 nan 2.800 nan
tongue211.0 0.656 nan 2.800 nan 2.800 nan
tongue212.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
tongue213.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
tongue214.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
tongue215.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
tongue216.0 0.657 nan 2.900 nan 2.900 nan
tongue217.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
tongue218.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
tongue219.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
tongue220.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
BarcodeSequenceSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
AACGCACGCTAG10.0 0.538 nan 2.600 nan 2.200 nan
AACGCACGCTAG11.0 0.501 nan 3.200 nan 2.400 nan
AACGCACGCTAG12.0 0.611 nan 3.400 nan 2.700 nan
AACGCACGCTAG13.0 0.604 nan 4.200 nan 3.000 nan
AACGCACGCTAG14.0 0.604 nan 4.200 nan 3.000 nan
AACGCACGCTAG15.0 0.611 nan 3.700 nan 2.800 nan
AACGCACGCTAG16.0 0.630 nan 4.100 nan 3.000 nan
AACGCACGCTAG17.0 0.665 nan 5.200 nan 3.400 nan
AACGCACGCTAG18.0 0.612 nan 5.000 nan 3.300 nan
AACGCACGCTAG19.0 0.632 nan 5.600 nan 3.500 nan
AACGCACGCTAG20.0 0.666 nan 5.300 nan 3.400 nan
ACACTGTTCATG10.0 0.785 0.317 6.442 4.542 3.700 1.800
ACACTGTTCATG11.0 0.835 0.357 6.625 4.625 3.950 1.950
ACACTGTTCATG12.0 0.838 0.360 5.467 3.467 4.000 2.000
ACACTGTTCATG13.0 0.875 0.397 6.117 4.117 4.300 2.300
ACACTGTTCATG14.0 0.869 0.391 7.350 5.350 4.200 2.200
ACACTGTTCATG15.0 0.863 0.385 8.100 6.100 4.550 2.550
ACACTGTTCATG16.0 0.895 0.417 6.917 4.917 4.650 2.650
ACACTGTTCATG17.0 0.865 0.387 7.800 5.800 4.450 2.450
ACACTGTTCATG18.0 0.891 0.413 7.700 5.700 4.800 2.800
ACACTGTTCATG19.0 0.935 0.457 10.850 8.850 5.250 3.250
ACACTGTTCATG20.0 0.932 0.454 10.325 8.325 5.200 3.200
ACCAGACGATGC10.0 0.458 0.058 1.733 0.544 1.667 0.478
ACCAGACGATGC11.0 0.448 0.051 1.700 0.535 1.567 0.403
ACCAGACGATGC12.0 0.461 0.059 1.833 0.624 1.700 0.497
ACCAGACGATGC13.0 0.458 0.058 1.733 0.544 1.667 0.478
ACCAGACGATGC14.0 0.464 0.062 1.867 0.660 1.733 0.525
ACCAGACGATGC15.0 0.472 0.072 1.867 0.660 1.767 0.556
ACCAGACGATGC16.0 0.487 0.089 2.067 0.899 1.867 0.660
ACCAGACGATGC17.0 0.468 0.066 1.867 0.660 1.767 0.556
ACCAGACGATGC18.0 0.493 0.098 2.200 1.071 1.933 0.736
ACCAGACGATGC19.0 0.493 0.098 2.200 1.071 1.933 0.736
ACCAGACGATGC20.0 0.488 0.090 2.133 0.984 1.900 0.698
AGTGAGAGAAGC10.0 0.600 nan 3.200 nan 2.600 nan
AGTGAGAGAAGC11.0 0.559 nan 3.200 nan 2.600 nan
AGTGAGAGAAGC12.0 0.596 nan 3.900 nan 3.000 nan
AGTGAGAGAAGC13.0 0.641 nan 3.400 nan 2.700 nan
AGTGAGAGAAGC14.0 0.566 nan 3.050 nan 2.700 nan
AGTGAGAGAAGC15.0 0.642 nan 3.750 nan 3.100 nan
AGTGAGAGAAGC16.0 0.642 nan 3.550 nan 3.000 nan
AGTGAGAGAAGC17.0 0.651 nan 4.700 nan 3.400 nan
AGTGAGAGAAGC18.0 0.647 nan 3.900 nan 3.500 nan
AGTGAGAGAAGC19.0 0.652 nan 4.950 nan 3.800 nan
AGTGAGAGAAGC20.0 0.652 nan 4.550 nan 3.800 nan
ATACTATTGCGC10.0 0.326 0.326 2.400 0.600 2.300 0.500
ATACTATTGCGC11.0 0.328 0.328 2.350 0.450 2.350 0.450
ATACTATTGCGC12.0 0.329 0.329 2.450 0.550 2.450 0.550
ATACTATTGCGC13.0 0.329 0.329 2.500 0.500 2.500 0.500
ATACTATTGCGC14.0 0.329 0.329 2.400 0.600 2.400 0.600
ATACTATTGCGC15.0 0.329 0.329 2.500 0.500 2.500 0.500
ATACTATTGCGC16.0 0.328 0.328 2.400 0.500 2.400 0.500
ATACTATTGCGC17.0 0.329 0.329 2.450 0.550 2.450 0.550
ATACTATTGCGC18.0 0.329 0.329 2.500 0.500 2.500 0.500
ATACTATTGCGC19.0 0.329 0.329 2.500 0.500 2.500 0.500
ATACTATTGCGC20.0 0.329 0.329 2.500 0.500 2.500 0.500
SampleTypeSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
L_palm10.0 0.820 0.282 6.792 4.192 3.850 1.650
L_palm11.0 0.846 0.346 7.225 4.025 4.150 1.750
L_palm12.0 0.905 0.294 6.167 2.767 4.350 1.650
L_palm13.0 0.938 0.334 7.217 3.017 4.800 1.800
L_palm14.0 0.932 0.328 8.450 4.250 4.700 1.700
L_palm15.0 0.929 0.318 8.950 5.250 4.950 2.150
L_palm16.0 0.971 0.341 7.967 3.867 5.150 2.150
L_palm17.0 0.958 0.293 9.400 4.200 5.150 1.750
L_palm18.0 0.958 0.346 9.200 4.200 5.450 2.150
L_palm19.0 1.012 0.380 12.650 7.050 6.000 2.500
L_palm20.0 1.025 0.360 11.975 6.675 5.900 2.500
Other10.0 0.000 nan 1.800 nan 1.800 nan
Other11.0 0.000 nan 1.900 nan 1.900 nan
Other12.0 0.000 nan 1.900 nan 1.900 nan
Other13.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
Other14.0 0.000 nan 1.800 nan 1.800 nan
Other15.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
Other16.0 0.000 nan 1.900 nan 1.900 nan
Other17.0 0.000 nan 1.900 nan 1.900 nan
Other18.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
Other19.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
Other20.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
Tongue10.0 0.626 0.026 3.100 0.100 2.700 0.100
Tongue11.0 0.608 0.048 3.000 0.200 2.700 0.100
Tongue12.0 0.627 0.031 3.450 0.450 3.000 nan
Tongue13.0 0.649 0.008 3.200 0.200 2.850 0.150
Tongue14.0 0.612 0.046 3.025 0.025 2.850 0.150
Tongue15.0 0.650 0.008 3.375 0.375 3.050 0.050
Tongue16.0 0.649 0.007 3.225 0.325 2.950 0.050
Tongue17.0 0.654 0.003 3.850 0.850 3.200 0.200
Tongue18.0 0.652 0.005 3.450 0.450 3.250 0.250
Tongue19.0 0.655 0.003 3.975 0.975 3.400 0.400
Tongue20.0 0.654 0.003 3.775 0.775 3.400 0.400
feces10.0 0.461 0.051 1.775 0.476 1.725 0.426
feces11.0 0.456 0.046 1.775 0.482 1.675 0.396
feces12.0 0.465 0.052 1.875 0.545 1.775 0.449
feces13.0 0.463 0.051 1.800 0.485 1.750 0.439
feces14.0 0.468 0.054 1.900 0.574 1.800 0.469
feces15.0 0.474 0.062 1.900 0.574 1.825 0.492
feces16.0 0.485 0.078 2.050 0.779 1.900 0.574
feces17.0 0.470 0.057 1.900 0.574 1.825 0.492
feces18.0 0.489 0.085 2.150 0.931 1.950 0.638
feces19.0 0.489 0.085 2.150 0.931 1.950 0.638
feces20.0 0.485 0.078 2.100 0.854 1.925 0.606
SampleIDSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
f110.0 0.468 nan 1.900 nan 1.900 nan
f111.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f112.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f113.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f114.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f115.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f116.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f117.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f118.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f119.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f120.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f210.0 0.524 nan 2.300 nan 2.100 nan
f211.0 0.504 nan 2.300 nan 1.900 nan
f212.0 0.524 nan 2.500 nan 2.100 nan
f213.0 0.524 nan 2.300 nan 2.100 nan
f214.0 0.533 nan 2.600 nan 2.200 nan
f215.0 0.557 nan 2.600 nan 2.300 nan
f216.0 0.600 nan 3.200 nan 2.600 nan
f217.0 0.543 nan 2.600 nan 2.300 nan
f218.0 0.620 nan 3.600 nan 2.800 nan
f219.0 0.620 nan 3.600 nan 2.800 nan
f220.0 0.603 nan 3.400 nan 2.700 nan
f310.0 0.468 nan 1.900 nan 1.900 nan
f311.0 0.459 nan 1.800 nan 1.800 nan
f312.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f313.0 0.468 nan 1.900 nan 1.900 nan
f314.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f315.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f316.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f317.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f318.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f319.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f320.0 0.478 nan 2.000 nan 2.000 nan
f410.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
f411.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
f412.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
f413.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
f414.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
f415.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
f416.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
f417.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
f418.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
f419.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
f420.0 0.382 nan 1.000 nan 1.000 nan
not16S.110.0 0.000 nan 1.800 nan 1.800 nan
not16S.111.0 0.000 nan 1.900 nan 1.900 nan
not16S.112.0 0.000 nan 1.900 nan 1.900 nan
not16S.113.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
not16S.114.0 0.000 nan 1.800 nan 1.800 nan
not16S.115.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
not16S.116.0 0.000 nan 1.900 nan 1.900 nan
not16S.117.0 0.000 nan 1.900 nan 1.900 nan
not16S.118.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
not16S.119.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
not16S.120.0 0.000 nan 2.000 nan 2.000 nan
p110.0 0.538 nan 2.600 nan 2.200 nan
p111.0 0.501 nan 3.200 nan 2.400 nan
p112.0 0.611 nan 3.400 nan 2.700 nan
p113.0 0.604 nan 4.200 nan 3.000 nan
p114.0 0.604 nan 4.200 nan 3.000 nan
p115.0 0.611 nan 3.700 nan 2.800 nan
p116.0 0.630 nan 4.100 nan 3.000 nan
p117.0 0.665 nan 5.200 nan 3.400 nan
p118.0 0.612 nan 5.000 nan 3.300 nan
p119.0 0.632 nan 5.600 nan 3.500 nan
p120.0 0.666 nan 5.300 nan 3.400 nan
p210.0 1.102 nan 10.983 nan 5.500 nan
p211.0 1.192 nan 11.250 nan 5.900 nan
p212.0 1.199 nan 8.933 nan 6.000 nan
p213.0 1.272 nan 10.233 nan 6.600 nan
p214.0 1.260 nan 12.700 nan 6.400 nan
p215.0 1.248 nan 14.200 nan 7.100 nan
p216.0 1.313 nan 11.833 nan 7.300 nan
p217.0 1.252 nan 13.600 nan 6.900 nan
p218.0 1.304 nan 13.400 nan 7.600 nan
p219.0 1.392 nan 19.700 nan 8.500 nan
p220.0 1.385 nan 18.650 nan 8.400 nan
t110.0 0.600 nan 3.200 nan 2.600 nan
t111.0 0.559 nan 3.200 nan 2.600 nan
t112.0 0.596 nan 3.900 nan 3.000 nan
t113.0 0.641 nan 3.400 nan 2.700 nan
t114.0 0.566 nan 3.050 nan 2.700 nan
t115.0 0.642 nan 3.750 nan 3.100 nan
t116.0 0.642 nan 3.550 nan 3.000 nan
t117.0 0.651 nan 4.700 nan 3.400 nan
t118.0 0.647 nan 3.900 nan 3.500 nan
t119.0 0.652 nan 4.950 nan 3.800 nan
t120.0 0.652 nan 4.550 nan 3.800 nan
t210.0 0.652 nan 3.000 nan 2.800 nan
t211.0 0.656 nan 2.800 nan 2.800 nan
t212.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
t213.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
t214.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
t215.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
t216.0 0.657 nan 2.900 nan 2.900 nan
t217.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
t218.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
t219.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
t220.0 0.657 nan 3.000 nan 3.000 nan
monthSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
1010.0 0.526 0.270 3.187 2.828 2.422 1.190
1011.0 0.526 0.292 3.272 2.899 2.478 1.307
1012.0 0.547 0.294 3.181 2.194 2.633 1.329
1013.0 0.558 0.314 3.337 2.595 2.700 1.500
1014.0 0.551 0.309 3.594 3.333 2.678 1.445
1015.0 0.562 0.307 3.806 3.768 2.811 1.634
1016.0 0.576 0.324 3.609 3.045 2.856 1.689
1017.0 0.567 0.310 4.000 3.628 2.878 1.602
1018.0 0.575 0.322 3.989 3.520 3.022 1.781
1019.0 0.588 0.345 4.872 5.429 3.178 2.052
1020.0 0.589 0.344 4.656 5.111 3.144 2.024
LinkerPrimerSequenceSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
GTGCCAGCMGCCGCGGTAA10.0 0.526 0.270 3.187 2.828 2.422 1.190
GTGCCAGCMGCCGCGGTAA11.0 0.526 0.292 3.272 2.899 2.478 1.307
GTGCCAGCMGCCGCGGTAA12.0 0.547 0.294 3.181 2.194 2.633 1.329
GTGCCAGCMGCCGCGGTAA13.0 0.558 0.314 3.337 2.595 2.700 1.500
GTGCCAGCMGCCGCGGTAA14.0 0.551 0.309 3.594 3.333 2.678 1.445
GTGCCAGCMGCCGCGGTAA15.0 0.562 0.307 3.806 3.768 2.811 1.634
GTGCCAGCMGCCGCGGTAA16.0 0.576 0.324 3.609 3.045 2.856 1.689
GTGCCAGCMGCCGCGGTAA17.0 0.567 0.310 4.000 3.628 2.878 1.602
GTGCCAGCMGCCGCGGTAA18.0 0.575 0.322 3.989 3.520 3.022 1.781
GTGCCAGCMGCCGCGGTAA19.0 0.588 0.345 4.872 5.429 3.178 2.052
GTGCCAGCMGCCGCGGTAA20.0 0.589 0.344 4.656 5.111 3.144 2.024
yearSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
200810.0 0.526 0.270 3.187 2.828 2.422 1.190
200811.0 0.526 0.292 3.272 2.899 2.478 1.307
200812.0 0.547 0.294 3.181 2.194 2.633 1.329
200813.0 0.558 0.314 3.337 2.595 2.700 1.500
200814.0 0.551 0.309 3.594 3.333 2.678 1.445
200815.0 0.562 0.307 3.806 3.768 2.811 1.634
200816.0 0.576 0.324 3.609 3.045 2.856 1.689
200817.0 0.567 0.310 4.000 3.628 2.878 1.602
200818.0 0.575 0.322 3.989 3.520 3.022 1.781
200819.0 0.588 0.345 4.872 5.429 3.178 2.052
200820.0 0.589 0.344 4.656 5.111 3.144 2.024
daySeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
2110.0 0.569 0.031 2.900 0.300 2.400 0.200
2111.0 0.530 0.029 3.200 nan 2.500 0.100
2112.0 0.604 0.008 3.650 0.250 2.850 0.150
2113.0 0.623 0.018 3.800 0.400 2.850 0.150
2114.0 0.585 0.019 3.625 0.575 2.850 0.150
2115.0 0.627 0.016 3.725 0.025 2.950 0.150
2116.0 0.636 0.006 3.825 0.275 3.000 nan
2117.0 0.658 0.007 4.950 0.250 3.400 nan
2118.0 0.629 0.018 4.450 0.550 3.400 0.100
2119.0 0.642 0.010 5.275 0.325 3.650 0.150
2120.0 0.659 0.007 4.925 0.375 3.600 0.200
2210.0 0.556 0.395 4.421 3.818 3.000 1.495
2211.0 0.582 0.426 4.487 3.920 3.150 1.626
2212.0 0.584 0.429 3.958 2.904 3.225 1.659
2213.0 0.602 0.455 4.308 3.445 3.400 1.892
2214.0 0.599 0.451 4.875 4.541 3.300 1.847
2215.0 0.596 0.447 5.300 5.155 3.525 2.104
2216.0 0.612 0.470 4.658 4.161 3.525 2.214
2217.0 0.597 0.448 5.125 4.912 3.450 2.038
2218.0 0.610 0.467 5.100 4.809 3.650 2.317
2219.0 0.632 0.501 6.675 7.531 3.875 2.701
2220.0 0.630 0.498 6.412 7.077 3.850 2.658
2310.0 0.458 0.058 1.733 0.544 1.667 0.478
2311.0 0.448 0.051 1.700 0.535 1.567 0.403
2312.0 0.461 0.059 1.833 0.624 1.700 0.497
2313.0 0.458 0.058 1.733 0.544 1.667 0.478
2314.0 0.464 0.062 1.867 0.660 1.733 0.525
2315.0 0.472 0.072 1.867 0.660 1.767 0.556
2316.0 0.487 0.089 2.067 0.899 1.867 0.660
2317.0 0.468 0.066 1.867 0.660 1.767 0.556
2318.0 0.493 0.098 2.200 1.071 1.933 0.736
2319.0 0.493 0.098 2.200 1.071 1.933 0.736
2320.0 0.488 0.090 2.133 0.984 1.900 0.698
subjectSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
110.0 0.526 0.270 3.187 2.828 2.422 1.190
111.0 0.526 0.292 3.272 2.899 2.478 1.307
112.0 0.547 0.294 3.181 2.194 2.633 1.329
113.0 0.558 0.314 3.337 2.595 2.700 1.500
114.0 0.551 0.309 3.594 3.333 2.678 1.445
115.0 0.562 0.307 3.806 3.768 2.811 1.634
116.0 0.576 0.324 3.609 3.045 2.856 1.689
117.0 0.567 0.310 4.000 3.628 2.878 1.602
118.0 0.575 0.322 3.989 3.520 3.022 1.781
119.0 0.588 0.345 4.872 5.429 3.178 2.052
120.0 0.589 0.344 4.656 5.111 3.144 2.024