Instellen van PermissiesAls je bij het installeren van de Quake II packages installatie rpm of tar als root uitvoerde, zouden de permissies reeds juist moeten zijn ingesteld. Het uitvoerbare bestand quake2 werd setuid root geïnstalleerd zodat het de grafische devices op je systeem kan benaderen. Voor beveiliging is root de eigenaar van de ref_*.so rendering libraries en kunnen ze alleen door root worden beschreven. Als root niet de eigenaar van de libraries is of als ze door iedereen te beschrijven zijn, dan zal quake2 weigeren op te starten.Als je van plan bent om Quake II met de GL- of X-renderers te draaien, is het niet nodig dat quake2 setuid root wordt ingesteld. Zie in de sectie Tips en Truuks hieronder voor meer informatie over het draaien van Quake II zonder root-permissies.

Quake2.conf Om beveiligingsredenen, bestaat er een quake2.conf bestand, waarin staat waar Quake II de rendering libraries (ref_*.so) kan vinden. Het bevat slechts één regel, wat het pad naar je Quake II installatie aan zou moeten geven. Quake II zoekt dit bestand op in /etc. Als je Quake II vanuit een .rpm bestand installeerde, is dit bestand al voor je geïnstalleerd. Als je vanuit een .tar package installeerde, zul je er als volgt een koppeling naar aan moeten maken:su root cd /usr/local/games/quake2 pwd > /etc/quake2.conf chmod 644 /etc/quake2.conf