PolyMatchWordStringKernel.cpp
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00009
00010
00011 #include "lib/common.h"
00012 #include "lib/io.h"
00013 #include "kernel/PolyMatchWordStringKernel.h"
00014 #include "kernel/SqrtDiagKernelNormalizer.h"
00015 #include "features/Features.h"
00016 #include "features/StringFeatures.h"
00017
00018 CPolyMatchWordStringKernel::CPolyMatchWordStringKernel(int32_t size, int32_t d, bool i)
00019 : CStringKernel<uint16_t>(size),degree(d),inhomogene(i)
00020 {
00021 set_normalizer(new CSqrtDiagKernelNormalizer());
00022 }
00023
00024 CPolyMatchWordStringKernel::CPolyMatchWordStringKernel(
00025 CStringFeatures<uint16_t>* l, CStringFeatures<uint16_t>* r, int32_t d, bool i)
00026 : CStringKernel<uint16_t>(10),degree(d),inhomogene(i)
00027 {
00028 set_normalizer(new CSqrtDiagKernelNormalizer());
00029 init(l, r);
00030 }
00031
00032 CPolyMatchWordStringKernel::~CPolyMatchWordStringKernel()
00033 {
00034 cleanup();
00035 }
00036
00037 bool CPolyMatchWordStringKernel::init(CFeatures* l, CFeatures* r)
00038 {
00039 CStringKernel<uint16_t>::init(l,r);
00040 return init_normalizer();
00041 }
00042
00043 void CPolyMatchWordStringKernel::cleanup()
00044 {
00045 CKernel::cleanup();
00046 }
00047
00048 bool CPolyMatchWordStringKernel::load_init(FILE* src)
00049 {
00050 return false;
00051 }
00052
00053 bool CPolyMatchWordStringKernel::save_init(FILE* dest)
00054 {
00055 return false;
00056 }
00057
00058 float64_t CPolyMatchWordStringKernel::compute(int32_t idx_a, int32_t idx_b)
00059 {
00060 int32_t alen, blen;
00061
00062 uint16_t* avec=((CStringFeatures<uint16_t>*) lhs)->get_feature_vector(idx_a, alen);
00063 uint16_t* bvec=((CStringFeatures<uint16_t>*) rhs)->get_feature_vector(idx_b, blen);
00064
00065 ASSERT(alen==blen);
00066
00067 int32_t sum=0;
00068
00069 for (int32_t i=0; i<alen; i++)
00070 sum+= (avec[i]==bvec[i]) ? 1 : 0;
00071
00072 if (inhomogene)
00073 sum+=1;
00074
00075 float64_t result=sum;
00076
00077 for (int32_t j=1; j<degree; j++)
00078 result*=sum;
00079
00080 return result;
00081 }