MatchWordStringKernel.cpp
Go to the documentation of this file.00001
00002
00003
00004
00005
00006
00007
00008
00009
00010
00011 #include "lib/common.h"
00012 #include "lib/Mathematics.h"
00013 #include "lib/io.h"
00014 #include "kernel/MatchWordStringKernel.h"
00015 #include "kernel/AvgDiagKernelNormalizer.h"
00016 #include "features/StringFeatures.h"
00017
00018 CMatchWordStringKernel::CMatchWordStringKernel(int32_t size, int32_t d)
00019 : CStringKernel<uint16_t>(size), degree(d)
00020 {
00021 set_normalizer(new CAvgDiagKernelNormalizer());
00022 }
00023
00024 CMatchWordStringKernel::CMatchWordStringKernel(CStringFeatures<uint16_t>* l, CStringFeatures<uint16_t>* r, int32_t d)
00025 : CStringKernel<uint16_t>(10), degree(d)
00026 {
00027 set_normalizer(new CAvgDiagKernelNormalizer());
00028 init(l, r);
00029 }
00030
00031 CMatchWordStringKernel::~CMatchWordStringKernel()
00032 {
00033 cleanup();
00034 }
00035
00036 bool CMatchWordStringKernel::init(CFeatures* l, CFeatures* r)
00037 {
00038 CStringKernel<uint16_t>::init(l, r);
00039 return init_normalizer();
00040 }
00041
00042 bool CMatchWordStringKernel::load_init(FILE* src)
00043 {
00044 return false;
00045 }
00046
00047 bool CMatchWordStringKernel::save_init(FILE* dest)
00048 {
00049 return false;
00050 }
00051
00052 float64_t CMatchWordStringKernel::compute(int32_t idx_a, int32_t idx_b)
00053 {
00054 int32_t alen, blen;
00055
00056 uint16_t* avec=((CStringFeatures<uint16_t>*) lhs)->get_feature_vector(idx_a, alen);
00057 uint16_t* bvec=((CStringFeatures<uint16_t>*) rhs)->get_feature_vector(idx_b, blen);
00058
00059 ASSERT(alen==blen);
00060
00061 float64_t sum=0;
00062 for (int32_t i=0; i<alen; i++)
00063 sum+= (avec[i]==bvec[i]) ? 1 : 0;
00064
00065 return CMath::pow(sum, degree);
00066 }