FixedDegreeStringKernel.cpp
Go to the documentation of this file.00001
00002
00003
00004
00005
00006
00007
00008
00009
00010
00011 #include "lib/common.h"
00012 #include "kernel/FixedDegreeStringKernel.h"
00013 #include "kernel/SqrtDiagKernelNormalizer.h"
00014 #include "features/Features.h"
00015 #include "features/StringFeatures.h"
00016 #include "lib/io.h"
00017
00018 CFixedDegreeStringKernel::CFixedDegreeStringKernel(int32_t size, int32_t d)
00019 : CStringKernel<char>(size), degree(d)
00020 {
00021 set_normalizer(new CSqrtDiagKernelNormalizer());
00022 }
00023
00024 CFixedDegreeStringKernel::CFixedDegreeStringKernel(
00025 CStringFeatures<char>* l, CStringFeatures<char>* r, int32_t d)
00026 : CStringKernel<char>(10), degree(d)
00027 {
00028 set_normalizer(new CSqrtDiagKernelNormalizer());
00029 init(l, r);
00030 }
00031
00032 CFixedDegreeStringKernel::~CFixedDegreeStringKernel()
00033 {
00034 cleanup();
00035 }
00036
00037 bool CFixedDegreeStringKernel::init(CFeatures* l, CFeatures* r)
00038 {
00039 CStringKernel<char>::init(l, r);
00040 return init_normalizer();
00041 }
00042
00043 void CFixedDegreeStringKernel::cleanup()
00044 {
00045 CKernel::cleanup();
00046 }
00047
00048 bool CFixedDegreeStringKernel::load_init(FILE* src)
00049 {
00050 return false;
00051 }
00052
00053 bool CFixedDegreeStringKernel::save_init(FILE* dest)
00054 {
00055 return false;
00056 }
00057
00058 float64_t CFixedDegreeStringKernel::compute(int32_t idx_a, int32_t idx_b)
00059 {
00060 int32_t alen, blen;
00061
00062 char* avec = ((CStringFeatures<char>*) lhs)->get_feature_vector(idx_a, alen);
00063 char* bvec = ((CStringFeatures<char>*) rhs)->get_feature_vector(idx_b, blen);
00064
00065
00066 ASSERT(alen==blen);
00067
00068 int64_t sum = 0;
00069 for (int32_t i = 0; i<alen-degree+1; i++)
00070 {
00071 bool match = true;
00072
00073 for (int32_t j = i; j<i+degree && match; j++)
00074 match = avec[j]==bvec[j];
00075 if (match)
00076 sum++;
00077 }
00078 return sum;
00079 }