MEncoder może tworzyć pliki formatu MPEG (MPEG-PS). Jest to prawdopodobnie użyteczne tylko z kodekiem mpeg1video pochodzącym z libavcodec, ponieważ odtwarzacze - za wyjątkiem MPlayera - oczekują obrazu zakodowanego w MPEG1 i strumienia dźwiękowego w MPEG1 warstwa (layer) 2 (MP2) w pliku MPEG.
Cecha ta nie jest zbytnio przydatna w tej chwili, poza tym zawiera prawdopodobnie wiele błędów, ale najważniejsze jest to, że MEncoder w tej chwili nie może kodować 2 warstwy MPEG1 (MP2) audio której oczekują wszystkie odtwarzacze w plikach MPEG.
Aby zmienić wyjściowy format plików MEncodera, użyj opcji -of mpeg.
Przykład:
mencoder -of mpeg -ovc lavc -lavcopts vcodec=mpeg1video -oac copy inne opcje media.avi -o wyjscie.mpg